Projekt Stanje reke Reke, vpliv turizma na jamski habitat v turističnem delu Škocjanskih jam, pregled stanja lampenflore in svetovanje pri omejevanju njene rasti Trajanje projekta: 23. marec 2016–31. december 2016
Projekt Znanstveni temelji za varstvo človeške ribice (proteus anguinus): metodologija monitoringa, ocena izhodiščnega stanja ter identifikacija varstveno pomembnih enot Trajanje projekta: 1. oktober 2014–30. september 2017 Vodja projekta: dr. Peter Trontelj Šifra: L1-6731 (D)
Projekt Ocena vpliva naravnih in antropogenih procesov na mikrometeorologijo Postojnske jame z uporabo numeričnih modelov ter sodobnih metod zajemanja in prenosa okoljskih podatkov Trajanje projekta: 1. oktober 2014–30. september 2017 Šifra: L2-6762 (B)
Projekt Preučevanje mikrobioma kraških podzemnih voda z novejšimi pristopi v metagenomiki Trajanje projekta: 1. julij 2014–30. junij 2017 Vodja projekta: dr. Blaž Stres Šifra: J1-6741
Projekt Krasoslovne raziskave za trajnostno rabo Škocjanskih jam kot svetovne dediščine Trajanje projekta: 1. maj 2017–30. april 2021 Šifra: L7-8268
Projekt Vzdrževanje in razvoj eksperimentalnih porečij, raziskave na eksperimentalnih porečjih ZRC SAZU Trajanje projekta: 19. januar 2017–5. november 2017
Projekt Life Watch Trajanje projekta: 1. februar 2008–31. januar 2011 Vodja projekta: doc. dr. Tanja Pipan Šifra: 211372
Projekt Meritve in analiza izbranih klimatskih parametrov v kraških jamah: Primer sistema Postojnskih jam Trajanje projekta: 1. maj 2009–30. april 2012 Šifra: L6-2156-0618
Projekt Žvepleni izviri v Sloveniji s krasoslovnega vidika in njihova mikrobiota Trajanje projekta: 1. februar 2008–31. januar 2011 Šifra: J6-0152-0618-08
Projekt Informacijsko-tehnološka mreža za integriranje dolgoročnih ekoloških, biodiverzitetnih in socioekonomskih raziskav na krasu: LTER-Slovenija Trajanje projekta: 1. februar 2008–31. januar 2011 Šifra: J7-0546-0618-08