Projekt Skupni sistem vrednotenja trajnostnosti upravljanja z vodnimi viri parkov Škocjanske jame in Risnjak Trajanje projekta: 1. januar 2014–17. junij 2015 Vodja projekta: Javni zavod Park Škocjanske jame
Projekt GEP-Skupni geoinformacijski sistem (GIS) za varovanje virov pitne vode v izrednih dogodkih Trajanje projekta: 2. november 2011–30. oktober 2014
Program Raziskovanje krasa Trajanje programa: 1. januar 2009–31. december 2014 Vodja programa: dr. Tadej Slabe Šifra: P6-0119
Projekt Žvepleni izviri v Sloveniji s krasoslovnega vidika in njihova mikrobiota Trajanje projekta: 1. februar 2008–31. januar 2011 Šifra: J6-0152-0618-08
Projekt Informacijsko-tehnološka mreža za integriranje dolgoročnih ekoloških, biodiverzitetnih in socioekonomskih raziskav na krasu: LTER-Slovenija Trajanje projekta: 1. februar 2008–31. januar 2011 Šifra: J7-0546-0618-08
Projekt Naravni viri kraških turističnih jam: ravnovesje med varovanjem, izkoriščanjem in promocijo Trajanje projekta: 1. januar 2016–31. december 2018 Vodja projekta: dr. Janez Mulec
Projekt Integralni sistem poplavno vzdržnega prostorskega načrtovanja Trajanje projekta: 1. januar 2016–31. december 2018 Vodja projekta: dr. Barbara Goličnik Marušić Šifra: J5-7178
Projekt Karst Underground Protection (KUP) Trajanje projekta: 1. december 2009–1. december 2011 Vodja projekta: Ljuljana Dravec, dipl.ing.kem.teh. Šifra: 4300-378/2008
Projekt Preučevanje mikrobioma kraških podzemnih voda z novejšimi pristopi v metagenomiki Trajanje projekta: 1. julij 2014–30. junij 2017 Vodja projekta: dr. Blaž Stres Šifra: J1-6741
Projekt Modeliranje hidrološkega odziva nehomogenih povodij Trajanje projekta: 1. januar 2016–31. december 2018 Vodja projekta: Mitja Brilly (Fakulteta za gradbeništvo in geodezijo, Univerza v Ljubljani) Šifra: J2-7322 (D)