Kataster jam, ki se v duplikatu vodi z Jamarsko zvezo Slovenije, obsega vse registrirane jame v Republiki Sloveniji (15.095 jam konec leta 2022). Papirna dokumentacija (opisi, načrti, fotografije...) se vodi v omarah, iz nje pa je izpeljana tudi digitalna podatkovna baza.
Kartografska zbirka obsega 54 enot, v njej je 6846 tiskanih kart in 5126 risanih kart, načrtov, skic in diagramov. Kataster vodnih objektov – B obsega 869 številk (1 tekoči meter), kataster površinskih oblik – C 525 številk (0,6 tm); kataster umetnih objektov – D (rudnikov, tunelov, vodnjakov in vrtin) 85 številk (0,1 tm), kataster predvojnega Istituto Italiano de Speleologia / Italijanskega speleološkega inštituta – VG pa 3700 številk (4 tm gradiva). Zapuščinski fondi bivših sodelavcev, ki vsebujejo tipkopise, rokopise, korekture, fotografsko in ostalo gradivo, obsegajo 41 tm, arhiv tajništva inštituta pa 68 tm. Navedeni podatki so iz leta 2021.